Het archief van het Klein Seminarie beslaat ongeveer tweehonderd meter aan documenten van de augustijnentijd tot vandaag. Daarnaast wordt er een ruime verzameling didactisch materiaal en handboeken bewaard.
Het archief bevat onder meer alle palmaressen van 1806 tot vandaag, economaatsboeken, internaats- en externaatsboeken, puntenboeken, de verslagboeken van de verschillende congregaties en verenigingen en van de zoeavenbeweging, briefwisseling, een rijke fotoverzameling, een eigen bibliotheek, uitgebreide bundels over schooltoneel, KSA, beroemde oud-leerlingen en oud-leraars en over het verleden van de land- en tuinbouwschool. Daarnaast bestaat er nog een apart muziekarchief.
Enkele pronkstukken zijn het dodenmasker van Guido Gezelle, een handschrift van Albrecht Rodenbach, de honderden opstellen van de Lettergilde, 18e-eeuwse notariële akten en een gedeelte van het persoonlijk archief van Edouard De Gryse.
